西湖大学开发ESM-Ezy:一种用于挖掘高性能酶的深度学习策略

西湖大学研究团队开发了一种名为ESM-Ezy的新策略,利用ESM-1b蛋白质语言模型和语义空间相似性计算,成功挖掘出具有优异催化性能的新型多铜氧化酶(MCO),并在环境修复和生物修复应用中表现出色。

该研究通过微调ESM-1b并选择与查询酶较短欧几里得距离的候选者,识别出低序列相似度(大多低于35%)的新MCO,催化性能显著优于查询酶,成功率高达44%。

ESM-Ezy为发现具有低序列相似性的高性能生物催化剂提供了一种有前景的方法,有望广泛应用于各种工业环境。

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